Ja, könnte es
Ich hatte damals arge Probleme mit Mods und einer bestimmten FOMM-Version. Hab entsprechend immer die Version 0.9.15 genommen, da anscheinend alles darüber anders mit den Modikfikationsdateien umgeht. Jedenfalls hatte ich damals mit höheren Versionen andauernd fehlende Texturen im Spiel(rote Ausrufezeichen etc.).
Ich weiss, dass auf dem Nexus die aktuellste Version vertrieben wird - gut, dass ich mein Backup von damals immer noch hab(liegt alles schön sortiert auf ner externen 1,5TB-Platte).
Kann es sein, dass du die Steam-GOTY hast? Mit der hatte ich andauernd Probleme..
Edit: Falls es nicht klappt, hier kannst du die alte FOMM-Version runterladen, die mir nie Probleme gemacht hat. Einfach entpacken und in den Fallout3-Ordner werfen(also da, wo die Fallout3.exe etc. liegt - NICHT in den Data-Ordner!)